自考毕业后申请论文的流程如下：
网上申请与缴费
符合毕业论文报名条件的同学，需在学校要求的报名网址参加报名，提交申请，并缴纳论文报名审核费。未按时缴纳报名审核费的，视为主动放弃报名。
确定指导老师与选题
报名结束后，学校会在官网公布论文指导安排，考生需及时加群（通常是QQ群），并在学校给的选题里面选一个适合自己的，也可以自己选题，但需得到指导老师的认可。
撰写论文提纲或开题报告
选题确定后，需撰写论文提纲或开题报告。提纲展现论文的主要框架和思路，开题报告则更全面，包含选题意义、国内外研究现状、主要研究内容、研究方法和思路、研究工作安排和进度以及参考文献。
撰写论文初稿
在确定选题并通过指导老师审核后，开始撰写论文初稿。初稿的目的是整理收集来的资料，根据框架将内容补充好，至少有一、二级标题，使内容更丰满。建议集中安排时间撰写，避免三天打鱼两天晒网，并养成保存和备份的习惯。
论文查重与修改
完成初稿后，需对论文进行查重。大多数院校要求论文的查重率低于一定比例（通常30-20%）。查重后，根据查重报告的反馈意见对论文进行修改，确保论文的原创性和学术性。
论文答辩
论文完成后，需准备论文答辩。答辩通常包括论文的口头报告和答辩委员会的提问。考生需提前熟悉论文的每一个细节，清楚自己论文中的研究问题、研究方法以及研究结论。
提交论文
答辩通过后，按照要求提交最终论文。提交的材料通常包括打印稿和电子稿（可能还需要刻盘）。
等待成绩
提交论文并通过答辩后，需等待成绩公布。
建议
提前准备：毕业论文的撰写和答辩需要充足的时间准备，建议提前了解并熟悉各项流程，合理安排时间。
选择合适的选题：选题应具有学术价值和创新性，同时要确保自己能在限定的时间内完成相应的研究工作。
保持与导师沟通：在撰写过程中，需定期与导师沟通，及时反馈进展和遇到的问题，以确保论文的质量。
注意查重率：查重是论文撰写过程中的重要环节，需确保论文的原创性，避免抄袭。
