灵活就业人员在入狱期间是无法缴纳医疗保险的。根据相关规定，服刑期间的一切社会保险都是停止缴纳的。但是， 刑满释放或假释后，可以重新办理医疗保险。具体步骤如下：
刑满释放或假释后，凭相关材料到社保经办机构办理续保手续。
参保人员于每年9月1日至11月30日办理参保手续，按缴费标准缴纳次年的城乡居民基本医疗保险费。
未在规定参保期内办理参保缴费手续的社区服刑人员，按缴费标准一次性缴纳当年城乡居民基本医疗保险费。
因此，建议灵活就业人员在刑满释放或假释后，及时到当地社保经办机构办理医疗保险的续保手续，并按时缴纳相应的医疗保险费，以确保自己的医疗保障权益不受影响。
