灵活就业者未能按时缴纳医保费用的原因可能包括以下几点：
医保系统升级
医保系统可能正在进行升级，导致暂时无法使用，从而影响缴费。
银行缴费账户问题
用于个人缴费的银行账户可能存在问题，如冻结、挂失、销户等，导致无法正常扣款。
扣款协议失效
如果与银行签订的扣款协议失效，也会导致扣款失败。
账户余额不足
银行缴费账户内的可用余额不足，无法完成扣款。
系统故障或操作不当
医保缴费系统可能出现故障或者由于当事人操作不当导致缴费失败。
未及时调整缴费工资
如果灵活就业者的缴费工资未及时调整，可能会导致缴费金额不准确，从而影响缴费。
自主申报缴费模式
灵活就业人员缴纳医保费已全面实行自主申报缴费模式，系统仅支持“当年缴当年”的医保费，跨年后不能再缴纳上年度的费款。
建议
检查银行账户状态：确保用于缴费的银行账户状态正常，无冻结、挂失、销户等情况。
确认扣款协议有效：检查与银行签订的扣款协议是否有效。
及时缴纳医保费用：根据医保政策，及时缴纳当年的医保费用，避免跨年后无法补缴。
关注系统升级通知：留意医保系统的升级通知，并在系统恢复后尽快完成缴费。
咨询当地医保局：如果以上方法都无法解决问题，建议咨询当地医保局或税务局，获取更详细的指导和帮助。
通过以上措施，灵活就业者可以更好地理解和解决医保缴费问题，确保自己的医保权益不受影响。
