深圳自考申请免考的流程如下：
登录系统
考生需要登录广东省自学考试管理系统。
提交申请
通过考籍管理模块中的免考功能提交免考申请。
准备材料
提交以下材料的原件及复印件：
身份证
准考证
毕业证书
完整成绩表或等级证书的原件及复印件。
如果成绩表需要从原毕业学校复印，则须由原毕业学校教务处在复印件上加盖公章。
如果成绩表需要从本人档案中复印，档案所在单位劳动人事部门须在复印件上签署意见，并加盖公章。
提交材料
向当地县（区）自学考试办公室（考办）提交上述材料。
审核过程
县（区）考办收集考生材料，并上报市考办进行审核。
市考办验核材料后，在复印件上签署意见并加盖公章，原件交县（区）考办退回考生；打印《免考审核表》与复印件材料一并上报省考办。
省考办审核后，考生通过系统查询审核结果。
查询结果
审核通过后，考生可以通过系统查询办理结果。
课程顶替
如果考生办理的免考课程与原已有成绩的课程存在课程顶替关系，则无需办理免考手续。
归档
一旦考试院审核通过，考生的免考信息就会生效，并且申请单的状态会显示为归档，这表明免考申请已经成功。
建议：
在申请免考前，请确保所有材料齐全且有效。
了解并确认自己的免考资格和条件，以便更顺利地完成申请流程。
及时关注系统通知和审核结果，以便及时处理可能出现的问题。
